Игровой процесс по сравнению с первой частью игры претерпел огромные изменения. Во-первых, к прыжку и вращению главного героя добавились такие приёмы как подкат, двойные прыжки и ползки. Особо стоит отметить забавный приём, когда Крэш, прыгая в воздухе и задерживаясь на доли секунды, вдруг с грохотом падает вниз, разбивая своей мордой ящик (или асфальт, в случае когда ящика нет). Процесс приобретения драгоценностей остался неизменным: как обычно, на каждом из уровней прячется один крисстал и один(иногда два) камешка, получить которые можно будет только если разобьёшь все ящики. На некоторых уровнях можно получить два таких камня, в этом случае для получения второго нужно разгадать тот или иной секрет. Хитрые разработчики на этот раз спрятали цветные камни ещё глубже, поэтому дабы отыскать их вам потребуется приложить неимоверную сообразительность. Чтобы добраться до этих скрытых мест, вам иногда потребуется искать ключи к разгадке в совершенно других уровнях. Однако Naughty Dog облегчили задание тем, что пометили над каждым из порталов входа в уровень, какие именно драгоценности вы можете отыскать там (например, во втором уровне Snow Go нам может встретиться запрятанный красный камешек). Какие такие порталы, что он несёт, спросите вы? Поясню: теперь вы можете выбирать сами, в какой уровень пойти Крэшу. Дело в том, что изначально главный герой находится в некой Warp Room, откуда вы можете путешествовать по мирам. В каждой такой комнате по пять уровней. Всего таких комнат 5 (плюс секретная). При переходе из одной комнаты в другую Крэшу будет нужно сражаться с боссами. Иногда вы сможете видеть во время путешествия по уровню некие платформы с изображением вопроса. Не бойтесь их, это дорога к бонусам. Сами бонусы построены практически так же, как и в первой части, так что опустим подробности этого дела. Однако помимо вышеописанных платформ вам могут встретиться и другие — с изображением черепа. Думаю, итак понятно, что ничего хорошего такой знак не предвещает. Итак, если вы встали на одну из таких платформ, вас отправят на, так называемую, «трудную дорожку», после прохождения которой, вас, естественно, ожидает вознаграждение.

В игре появились снежные уровни, где можно вволю покататься на льду. Каждый из миров наполнен своими особенностями, в том числе и особенными врагами. Так, например, в снежных уровнях вас ожидает встреча с тюленями и пингвинами, а в канализационных уровнях со сварщиками и крысами-мутантами. Ближе к концу игры Крэшу посчастливится очутиться на заводах Кортекса и даже отправиться в космос. На двух уровнях Крэш получит способность зарываться в землю от кусающихся пчёл. Также разработчики решили порадовать нас гонками на белом медвежонке, подобно Hog wild из первой части, и погонями от огромных катящихся валунов(в духе Индианы Джонса), подобно Boulder dash из той же первой части. Смерти героя смотрятся также забавно (а может даже и ещё забавнее), как в игре-предшественнице.